Thèse dirigée par Marie-Noëlle Brisset, UMR Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS)

Résumé

L’objectif de cette thèse visait à étudier l’efficacité et le déterminisme moléculaire de deux leviers immunitaires seuls ou en combinaison sur la protection du pommier vis-vis de deux de ses principaux bioagresseurs : la bactérie Erwinia amylovora (agent du feu bactérien) et le champignon Venturia inaequalis (agent de la tavelure). L’effet d’une limitation transitoire en N suivi d’une phase de renutrition, et d’un stimulateur de défense des plantes (SDP), l’ASM (ou acibenzolar-S-methyl) ont été étudiées sur jeunes semis de pommier en conditions semicontrôlées. Ces deux leviers combinés ont permis une protection remarquable vis-à-vis des deux maladies, bien supérieure à celle conférée par chaque levier. Le bilan des analyses
« omiques » effectuées en parallèle a révélé qu’en réponse à la limitation N ou à la renutrition N subséquente, les métabolismes N et C sont fortement modifiés avec une accumulation de composés secondaires à forte activité biologique potentielle vis-à-vis des deux bioagresseurs ainsi qu’une légère induction des gènes défenses. Le traitement ASM entraîne également un profond remaniement des métabolismes N et C permettant la réorientation des ressources vers la biosynthèse de composés secondaires appartenant aux mêmes familles mais complémentaires et des protéines de défense. Les analyses des effets de la combinaison de ces deux leviers montrent l’intensification de certaines réponses observées avec chacun des leviers et surtout une additivité de réponses complémentaires plutôt qu’une réponse spécifique. Ainsi, le gain de protection observée avec la combinaison des 2 leviers pourrait résulter de la création d’un environnement défavorable aux deux agents pathogènes sur divers plans : nutrition, activation des facteurs du pouvoir pathogène, composés antimicrobiens diversifiés. La mise en oeuvre de ces résultats en conditions de production constitue un challenge afin d’atteindre le meilleur compromis entre immunité et productivité du pommier.

Mots clés : Azote, SDP, Erwinia amylovora, Venturia inaequalis, pommier, immunité